O Conselho, anualmente, dentre os presbíteros em pleno exercício do presbiterato, nomeará um conselheiro para a Junta Diaconal, que terá a função de acompanha-la em suas atividades, apresentar ao Conselho as suas demandas e presidir a reunião da Junta para o cumprimento do regulamento interno. A Junta Diaconal da Segunda Igreja Presbiteriana de Jundiaí por sua vez é constituída de todos os diáconos que coordenam as funções estabelecidas pelo conselho e definidas em seu presente regimento interno.
A diretoria da Junta Diaconal compor-se-á de presidente, vice-presidente, tesoureiro e secretário, eleitos anualmente, mediante reunião convocada pelo presidente da Junta e dirigida por membro do Conselho, com quorum mínimo de metade dos diáconos em atividade, sendo eleito o diácono que tiver maioria simples dos votos.
Conhecendo o regulamento interno da nossa igreja, veja abaixo os diáconos eleitos e ativos: